Tổng hợp kết quả các cuộc thanh tra đã lưu hành kết luận, Thanh tra Bộ Tài chính đã phát hiện và kiến nghị xử lý về tài chính trên 1.032 tỷ đồng, qua đó tăng thu ngân sách Nhà nước 448,9 tỷ đồng; giảm chi ngân sách 246,8 tỷ đồng; xử lý tài chính khác 336,3 tỷ đồng.

Cũng trong năm 2012, Thanh tra Bộ Tài chính đã chú trọng thực hiện các cuộc thanh tra chuyên đề diện rộng như chuyên đề về công tác quản lý tài chính và các yếu tố hình thành giá điện tại các doanh nghiệp sản xuất điện ngoài EVN, chuyên đề về quản lý và sử dụng nguồn vốn vay bảo lãnh của Chính phủ, chuyên đề quản lý hải quan đối với hàng tạm nhập tái xuất,…

Việc thanh tra chuyên đề đã giúp Thanh tra Bộ Tài chính đánh giá một cách toàn diện việc thực hiện cơ chế, chính sách, từ đó kịp thời đưa ra giải pháp, tham mưu giúp Lãnh đạo Bộ trong công tác quản lý và điều hành.