Về thủ tục hải quan đối với hàng hóa xuất nhập khẩu tại chỗ quy định tại Điều 45, nếu doanh nghiệp áp dụng thủ tục hải quan điện tử thì tiếp tục thực hiện theo hướng dẫn tại Điều 47 Thông tư số 196/2012/TT-BTC ngày 15/11/2012 của Bộ Tài chính; nếu doanh nghiệp áp dụng thủ tục hải quan truyền thống thì thực hiện theo hướng dẫn tại Điều 45 Thông tư số 128/2013/TT-BTC nêu trên.

doanh nghiệp cũng thực hiện theo quy định tại Điều 45 Thông tư số 128/2013/TT-BTC với trường hợp thủ tục xuất khẩu, nhập khẩu tại chỗ được thực hiện tại 02 đơn vị hải quan khác nhau nhưng 01 đơn vị hải quan áp dụng hải quan điện tử và 01 đơn vị hải quan áp dụng thủ tục hải quan truyền thống.

 

Tổng cục Hải quan cũng cho biết hướng dẫn này áp dụng đối với cả hàng hóa mua bán giữa doanh nghiệp chế xuất và nội địa.

Về địa điểm làm thủ tục hải quan đối với hàng nhập SXXK quy định tại Điều 36, nếu doanh nghiệp không có cơ sở sản xuất tại TP. Hồ Chí Minh, Hải Phòng,… thì thực hiện theo quy định tại điểm a khoản 1 Điều 36 Thông tư số 128/2013/TT-BTC. Theo đó, doanh nghiệp làm thủ tục hải quan tại Chi cục Hải quan thuộc Cục Hải quan tỉnh, thành phố nơi doanh nghiệp có cơ sở sản xuất.

 

Trường hợp doanh nghiệp còn các tờ khai nhập khẩu chưa được thanh khoản vì lý do chưa xuất khẩu hết sản phẩm thì doanh nghiệp thực hiện cho đến khi thanh khoản xong các tờ khai nhập khẩu. Các tờ khai nhập khẩu phát sinh mới thì thực hiện theo đúng quy định tại Điều 36 Thông tư số 128/2013/TT-BTC.

 

Trường hợp doanh nghiệp nhập khẩu nguyên liệu để sản xuất hàng hóa xuất khẩu nhưng không trực tiếp sản xuất mà thuê doanh nghiệp khác sản xuất, gia công thuộc cùng một Cục Hải quan quản lý thì được lựa chọn làm thủ tục hải quan tại 01 Chi cục Hải quan thuộc Cục Hải quan nơi doanh nghiệp nhận sản xuất gia công có cơ sở sản xuất. Nếu nơi doanh nghiệp có cơ sở sản xuất không có tổ chức hải quan thì doanh nghiệp được lựa chọn một Chi cục Hải quan thuận tiện thuộc Cục Hải quan quản lý địa bàn nơi doanh nghiệp có cơ sở sản xuất để làm thủ tục.

 

Cũng tại văn bản này, Tổng cục Hải quan hướng dẫn: Để đảm bảo công tác quản lý, quyết toán nguyên vật liệu nhập khẩu, nếu doanh nghiệp thuộc quy định tại điểm b, khoản 1 Điều 36 Thông tư số 128/2013/TT-BTC lựa chọn làm thủ tục hải quan đối với nguyên vật liệu nhập sản xuất xuất khẩu tại Chi cục Hải quan cửa khẩu nhập nhưng hàng hóa nhập khẩu qua nhiều cảng thuộc nhiều Chi cục Hải quan cửa khẩu quản lý thì được làm thủ tục hải quan tại một Chi cục Hải quan cửa khẩu nơi hàng đến.

 

Trường hợp lô hàng nhập khẩu phải kiểm tra thực tế hàng hóa thì Chi cục Hải quan nơi làm thủ tục nhập khẩu nguyên vật liệu cử cán bộ công chức thực hiện kiểm tra thực tế hàng hóa tại địa điểm lưu giữ hàng.