Quá trình đổi mới đơn vị sự nghiệp công lập bắt nguồn từ việc thực hiện thí điểm chế độ tài chính áp dụng cho đơn vị sự nghiệp công lập có thu theo Nghị định số 10/2002/NĐ-CP ngày 16/01/2002, tiếp theo đó là Nghị định số 43/2006/NĐ-CP ngày 25/4/2006 của Chính phủ quy định quyền tự chủ, tự chịu trách nhiệm về thực hiện nhiệm vụ, tổ chức bộ máy, biên chế và tài chính đối với đơn vị sự nghiệp công lập.