Theo Bộ Tài chính, tại điểm b khoản 4 Điều 11 Nghị định số 126/2020/NĐ-CP quy định, đơn vị được doanh nghiệp giao thực hiện nhiệm vụ tiêu thụ than có trách nhiệm khai thuế bảo vệ môi trường phát sinh đối với than thu mua của các công ty khai thác than để tiêu thụ nội địa.

Tuy nhiên, với mô hình doanh nghiệp thực hiện khai thác và tiêu thụ than tập trung, điển hình như trường hợp của Tập đoàn Công nghiệp Than - Khoáng sản Việt Nam thì ngoài số than thu được từ khâu khai thác chuyển cho đơn vị có chức năng tiêu thụ còn một số lượng than thu được từ các đơn vị có nhiệm vụ sàng tuyển, chế biến chuyển cho đơn vị có chức năng tiêu thụ để xuất khẩu và tiêu thụ nội địa.

Việc quy định đơn vị làm nhiệm vụ tiêu thụ than thực hiện khai thuế bảo vệ môi trường đối với toàn bộ số than thu mua của các công ty khai thác than là chưa đầy đủ, thiếu phần sản lượng than tiêu thụ nội địa thu mua từ các công ty sàng tuyển, chế biến than trong cùng Tập đoàn.

Từ những bất cập trên, Bộ Tài chính cho rằng cần thiết sửa đổi, bổ sung điểm b khoản 4 Điều 11 Nghị định số 126/2020/NĐ-CP theo hướng: Doanh nghiệp có hoạt động khai thác và tiêu thụ than nội địa thông qua hình thức quản lý và giao cho các công ty con hoặc đơn vị phụ thuộc khai thác, chế biến và tiêu thụ thì đơn vị thực hiện nhiệm vụ tiêu thụ than thực hiện khai thuế cho toàn bộ số thuế bảo vệ môi trường phát sinh đối với than khai thác thuộc diện chịu thuế và nộp hồ sơ khai thuế đến cơ quan thuế quản lý trực tiếp kèm theo Bảng xác định số thuế phải nộp cho từng địa phương nơi có công ty khai thác than đóng trụ sở theo quy định của Bộ trưởng Bộ Tài chính.