Theo đó, việc kiểm tra sẽ tập trung vào DN chấp hành về trưng biển, in, sử dụng hoá đơn GTGT kiêm tờ khai hoàn thuế... Bên cạnh đó, ngành Thuế tiếp tục rà soát  các DN có tiềm năng, bán hàng hoàn thuế GTGT để tổ chức hội nghị phổ biến, tuyên truyền khuyến khích DN tham gia bán hàng thí điểm hoàn thuế GTGT. Cơ quan Thuế sẽ cập nhật kịp thời danh sách DN, cửa hàng đăng ký DN bán hàng thí điểm hoàn thuế GTGT đã được xét đủ điều kiện lên Website của Tổng cục Thuế và Cục thuế địa phương.

Tính đến hết tháng 12/2012, các cục Thuế đã thực hiện và rà soát lựa chọn DN có đủ điều kiện bán hàng thí điểm hoàn thuế GTGT cho người nước ngoài ở các trung tâm thương mại, các điểm đến của khách du lịch lữ hành để tổ chức tập huấn, tuyên truyền. Theo đó, đã có văn bản công nhận 47 DN bán hàng thí điểm, trong đó Cục thuế TP. Hồ Chí Minh có 32 DN, Hà Nội là 14 DN và Bình Dương có 1 DN; với tổng số điểm bán hàng là 189, trong đó TP. Hồ Chí Minh có 140 điểm, Hà Nội là 49 và Bình Dương có 1 điểm bán hàng.

Cũng theo đánh giá của Tổng cục Thuế, các DN được công nhận bán hàng thí điểm hoàn thuế GTGT cho người nước ngoài đã tiến hành in và phát hành hoá đơn theo quy định. Tại địa bàn Hà Nội đã có 14 DN in và phát hành 4.700 hoá đơn kiêm tờ khai hoàn thuế GTGT, địa bàn Bình Dương có 1DN đăng ký bán hàng thí điểm hoàn thuế nhưng chưa thực hiện được việc in hoá đơn.

Hiện cơ quan Thuế đã thanh toán số tiền hoàn thuế GTGT và phí dịch vụ hoàn thuế của Ngân hàng thương mại làm đại lý hoàn thuế GTGT là 4,346 tỷ đồng, trong đó Cục thuế TP. Hồ Chí Minh giải quyết hoàn thuế cho 21 hồ sơ, với tổng số tiền thanh toán cho các ngân hàng là 4,166 tỷ đồng (trong đó tiền thanh toán thuế GTGT là 3,54 tỷ đồng, số tiền thanh toán phí dịch vụ của ngân hàng là 624,9 triệu đồng, với tổng số người nước ngoài được giải quyết hoàn thuế GTGT tại sân bay Tân Sơn Nhất là 1.209 người); Cục thuế Hà Nội giải quyết 16 hồ sơ, với tổng số tiền thanh toán cho các ngân hàng thương mại là 180,5 triệu đồng, trong đó tiền thanh toán thuế GTGT là 153,4 triệu đồng, số tiền thanh toán phí dịch vụ của ngân hàng là 27,1 triệu đồng; với tổng số người nước ngoài được giải quyết hoàn thuế GTGT tại sân bay quốc tế Nội Bài là 106 người.

Tuy nhiên, theo Tổng cục Thuế trong quá trình thực hiện thí điểm hoàn thuế GTGT đối với hàng hoá của người nước ngoài mua tại Việt Nam mang theo khi xuất cảnh qua cửa khẩu sân bay quốc tế Nội Bài và Tân Sơn Nhất đã phát sinh một số vướng mắc như: Số lượng DN ở Hà Nội và TP. Hồ Chí Minh tham gia vào chương trình chưa nhiều, chưa tương xứng với quy mô của địa bàn. Trong khi đó, các DN tiềm năng chủ yếu là các hộ kinh doanh và cá nhân kinh doanh nhưng các hộ kinh doanh và cá nhân kinh doanh lại không muốn làm đại lý cho DN mà muốn được cấp trực tiếp đăng ký bán hàng, còn các DN bán hàng xuất khẩu chủ yếu theo lô do đó lượng đăng ký bán hàng thí điểm hoàn thuế GTGT đạt thấp.

Mặt khác, đa số các mặt hàng mà người nước ngoài hay mua mang theo khi xuất cảnh thường được mua ở các cửa hàng thuộc hộ kinh doanh cá thể nên việc hoàn thuế GTGT cho người nước ngoài thông qua các DN bán hàng thí điểm còn hạn chế.

Trên cơ sở đó, Cục Thuế Hà Nội đề nghị mở rộng đối tượng lựa chọn DN bán hàng thí điểm cho cả hộ kinh doanh và cá nhân kinh doanh (không phải thông qua địa lý bán hàng cho DN khác). Cục Thuế TP. Hồ Chí Minh đề xuất cần có cơ chế ưu đãi để thu hút thêm nhiều DN tham gia như: Cho phép các DN ở các tỉnh, thành khác tham gia bán hàng thí điểm, không bắt buộc phải là một trong các địa điểm ở Hà Nội hay TP. Hồ Chí Minh hoặc ở các trung tâm làng nghề thủ công mỹ nghệ trong điểm đến của các tuyến lữ hành du lịch.