2/ Năm 1996:
Xây dựng và triển khai chương trình mềm “Quản lý cán bộ kiểm tra hàng hóa” bắt buộc cán bộ kiểm hoá phải gọi điện thoại về Đội Kiểm soát Hải quan trước khi kiểm tra thực tế nhằm giám sát chặt chẽ việc làm của kiểm hoá viên cũng như tạo điều kiện thuận lợi để các lực lượng chức năng của Cục như Đội Kiểm soát Hải quan, Thanh tra có thể đến kiểm tra bất kỳ lúc nào.

4/ Năm 1998:
Triển khai chương trình phần mềm “Phân công kiểm hóa tự động" qua việc lựa chọn cán bộ kiểm tra một lô hàng được máy tính chọn ngẫu nhiên hoàn toàn và kết xuất ra màn hình lớn để doanh nghiệp biết, thuận tiện theo dõi, chống việc móc ngoặc, tiêu cực giữa Hải quan và doanh nghiệp; đồng thời, triển khai ứng dụng chương trình phần mềm “Tra cứu quản lý chứng thư giám định” nhằm đưa vào quản lý toàn bộ chứng thư giám định từng lô hàng trong cơ sở dữ liệu phục vụ tra cứu để áp mã số chính xác, thống nhất tránh thất thu thuế cho ngân sách.

5/ Năm 1999:
Cục Hải quan Đồng Nai là đơn vị đầu  tiên của tỉnh và của ngành Hải quan xây dựng Website để cung cấp thông tin, chế độ chính sách về Hải quan cho doanh nghiệp. Trang web được bổ sung tiếng Hoa, tiếng Anh, thể hiện tính công khai dân chủ và minh bạch trong các mặt hoạt động của Hải quan.
Xây dựng và áp dụng Quy trình thủ tục Hải quan đối với doanh nghiệp chế xuất trên địa bàn, kể cả các doanh nghiệp chế xuất không nằm trong khu công nghiệp, khu chế xuất tập trung khi chưa có hướng dẫn của ngành.

6/ Năm 2000:
Cục Hải quan Đồng Nai triển khai chương trình phần mềm “Quản lý công văn” nhằm mục đích kiểm tra thời hạn giải quyết và trả lời công văn cho doanh nghiệp.
Cục Hải quan Đồng Nai là đơn vị đầu tiên của Ngành xây dựng và thực hiện thống nhất Quy chế lưu mẫu, lưu ảnh trong hồ sơ Hải quan.

7/ Năm 2001:
Xây dựng và triển khai Quy chế luân chuyển, điều động cán bộ và Quy chế phân công đối với cán bộ có mối quan hệ gia đình với doanh nghiệp phục vụ hữu hiệu công tác tổ chức cán bộ.
- Xây dựng và hướng dẫn doanh nghiệp thực hiện qui trình thanh lý hàng gia công, nhập sản xuất xuất khẩu mang lại hiệu quả cao trong việc rút ngắn thời gian xem xét để ra quyết định không thu thuế, hoàn thuế.

8/ Năm 2002:
Chủ động xây dựng và thực hiện Quy chế thu thập thông tin donah nghiệp trong việc chấp hành pháp luật và thông tin chi tiết hàng hoá XNK để áp dụng quản lý rủi ro trong miễn kiểm tra hàng hoá XNK.

9/ Năm 2003:
Cục Hải quan Đồng Nai là đơn vị hành chính đầu tiên của Ngành và của tỉnh triển khai việc sử dụng máy chấm công bằng thẻ giấy để quản lý giờ giấc làm việc của cán bộ công chức.

10/ Năm 2004:
Đơn vị đầu tiên của ngành ứng dụng công nghệ thông tin để thực hiện quản lý thanh lý thuế tờ khai sản xuất xuất khẩu, thanh lý hợp đồng gia công bằng chương trình phần mềm.
Là đơn vị tiên phong triển khai khai báo hải quan qua đĩa mềm và phát triển bằng USB sau này cho tất cả các doanh nghiệp trên địa bàn để rút ngắn thời gian làm thủ tục hải quan trong khâu đăng ký.

11/ Năm 2005:
Thực hiện lắp đặt và sử dụng 01 Máy soi di động và 01 Máy soi cố định tại Chi cục Hải quan Biên Hòa và Chi cục Hải quan Long Bình Tân; từ đó việc kiểm tra hàng hoá thủ công được thay thế bằng hệ thống máy soi, nhanh chóng, chính xác, góp phần rút ngắn thời gian thong quan cho doanh nghiệp.
Triển khai  sử dụng “Hệ thống xếp hàng tự động” phục vụ đăng ký tờ khai tại Chi cục Hải quan KCX Long Bình và Hải quan Biên Hòa. Việc triển khai vừa tạo văn minh, ngăn chặn tiêu cực trong tiếp nhận, đăng ký tờ khai vừa làm cơ sở đánh giá năng lực cán bộ Hải quan khi giải quyết công việc do máy xác định cụ thể số lượng hồ sơ của từng cán bộ trong ngày. Qua đó, đã quán triệt thực hiện cơ chế “một cửa” tại Cục Hải quan Đồng Nai.
Trang bị Hệ thống camera quan sát tại quầy giao dịch và khu vực kiểm hàng hoá tại Chi cục Hải quan Long Bình Tân và Chi cục Hải quan Biên Hoà. Qua hệ thống camera giám sát chuyên dụng giúp lãnh đạo đơn vị giám sát việc hoạt động, thái độ phục vụ của công chức khi thực thi công vụ để có biện pháp quản lý, hạn chế tiêu cực.
Là đơn vị đầu tiên trong ngành thực hiện trả lương cho cán bộ công chức qua thẻ ATM đảm bảo văn minh, thuận lợi theo ý kiến chỉ đạo của Chính phủ, giảm hẳn nhân lực trong việc chi trả lương như trước đây.
Xây dựng chuyên mục “Tư vấn thủ tục Hải quan qua mạng” trên internet đểtrả lời trực tuyến vướng mắc của các cá nhân, tổ chức trên phạm vi toàn quốc, hình thành một kênh thông tin tiên tiến giúp doanh nghiệp nắm bắt pháp luật về Hải quan mà không cần đến trụ sở Hải quan hoặc gửi công văn bằng giấy để chờ phúc đáp cũng bằng văn bản.
Xây dựng chuyên mục “Hải quan Đồng Nai đồng hành cùng Doanh nghiệp” trên báo Đồng Nai và báo Bình Thuận. 
Cục Hải quan Đồng Nai là đơn vị đầu tiên và duy nhất của ngành Hải quan đã phối hợp cùng Kho bạc Đồng Nai thiết lập và đưa vào vận hành ổn định truyền nhận dữ liệu nộp thuế với tất cả các Chi cục Hải quan.
Cục Hải quan Đồng Nai cũng là đơn vị đầu tiên thực hiện xây dựng chương trình phần mềm“Cẩm nang tra cứu mã số thuế hàng hóa xuất nhập khẩu “ để làm cơ sở áp mã số thuế chính xác, tránh khiếu nại phức tạp. Năm 2008 chương trình được phát triển thành đề tài khoa học cấp ngành để triển khai ứng dụng toàn quốc cho các Cục Hải quan địa phương khác.

12/ Năm 2006:
Cục Hải quan Đồng Nai là đơn vị đầu tiên của ngành Hải quan Việt Nam triển khai áp dụng hệ thống tiêu chuẩn đo lường chất lượng theo tiêu chuẩn ISO và được tổ chức BVQI của Anh Quốc cấp Giấy chứng nhận quản lý theo tiêu chuẩn chất lượng ISO 9001:2000.
Do việc theo dõi và nhận lại tờ khai cũng là mối quan tâm của các doanh nghiệp, Cục Hải quan Đồng Nai chủ động xây dựng chương trình tin học “Quản lý tờ khai luân chuyển” phục vụ quản lý và theo dõi luân chuyển tờ khai Hải quan từ khi đăng ký luân chuyển đến các bước nghiệp vụ và trả cho doanh nghiệp. Việc ứng dụng đã thay thế hoàn toàn việc theo dõi, ghi chép thủ công bằng sổ sách, giúp quản lý được chính xác.   
Là một trong những đơn vị đầu tiên của Hải quan Việt Nam ứng dụng “Khai báo Hải quan từ xa” đối với loại hình sản xuất xuất khẩu cho các doanh nghiệp trên địa bàn.
Thực hiện chuyên mục “Hải quan Đồng Nai đồng hành cùng Doanh nghiệp” trên sóng FM của Đài PTTH Đồng Nai để tuyên truyền chính sách, pháp luật Hải quan các buổi tối vào “giờ vàng”.

13/ Năm 2007:
Là đơn vị đầu tiên của ngành Hải quan Việt Nam triển khai vận hành “Hệ thống giám sát tự động” để giám sát hàng hoá ra vào tạiChi cục Hải quan Long Bình Tân càng chính xác, giảm nhân lực. Hệ thống ghi nhận và mã hoá toàn bộ số container, số biển kiểm soát phương tiện vận tải ra vào ICD Biên Hoà thành cơ sở dữ liệu phục vụ quản lý theo chương trình phần mềm liên kết.

Cục Hải quan Đồng Nai là đơn vị đầu tiên của ngành Hải quan Việt Nam thí điểm triển khai thực hiện “Thu lệ phí Hải quan qua ngân hàng” thông qua hệ thống EDC của Ngân hàng Thương mại cổ phần Quốc tế - VIBank.
Là đơn vị triển khai sớm nhất chấm công bằng hệ thống nhận dạng vân tay trong toàn đơn vị trên cơ sở thực hiện giai đoạn đầu việc chấm công bằng thẻ giấy năm 2003.

14/ Năm 2008:
Cục Hải quan Đồng Nai triển khai ứng dụng việc phân loại, đánh giá cán bộ công chức bằng chương trình “Đánh giá, phân loại CBCC trên mạng nội bộ”giúp phân loạikhông phải thao tác bằng giấy thủ công và kết quả hoàn toàn chính xác theo các tiêu chí đánh giá cụ thể trên website nội bộ giúp tiết kiệm chi phí, thời gian.

15/ Năm 2009:
Đến nay Cục Hải quan Đồng Nai được trang bị hạ tầng công nghệ thông tin hiện đại với hệ thống mạng, đường truyền kết nối internet tốc độ cao hỗ trợ thiết bị wireless, đường truyền cáp quang...cùng hơn 20 phần mềm tự xây dựng và được Tổng cục Hải quan cài đặt, từ đó đã đảm bảo mang lại hiệu suất cao nhất trong công tác.
Triển khai thực hiện đề tài nghiên cứu khoa học cấp cơ sở "Xây dựng chương trình đánh giá năng lực cán bộ, công chức”. Khi triển khai giúp cán bộ công chức tự học tập nâng cao trình độ và giúp đơn vị đánh giá cán bộ công chức chính xác, toàn diện trên các lĩnh vực nghiệp vụ, tin học, ngoại ngữ,… phục vụ công tác tổ chức cán bộ hiệu quả nhất.
- Triển khai chương trình “Đăng ký danh mục hàng hoá nhập khẩu miễn thuế trực tuyến” nhằm giải quyết thủ tục hành chính nhanh chóng, giảm chi phí và thời gian đi lại của doanh nghiệp và hạn chế tiêu cực do tiếp xúc trực tiếp giữa CBCC và doanh nghiệp.
Xây dựngđịa điểm kiểm tra hàng hoá tập trung tại Khu công nghiệp Gò Dầu để phục vụ việc thông quan nhanh chóng hàng hoá tại khu vực Long Thành. Cho đến nay đã có 5 trụ sở của các Chi cục được xây dựng khang trang, thiết kế và trang bị theo hướng hiện đại, thuận tiện cho thực hiện quy trình nghiệp vụ và phục vụ hiệu quả doanh nghiệp. Tất cả các nghiệp vụ phát sinh được thực hiện theo cơ chế “một cửa” tại quầy giao dịch, có màn hình thông báo phân công kiểm hoá và chính sách mới, tạo thoải mái, văn minh công sở theo chủ trương chung của ngành.
Thực hiện thủ tục hải quan điện tử. Năm 2009, Cục Hải quan Đồng Nai chủ động đề xuất và được Tổng cục Hải quan phê duyệt Kế hoạch triển khai thủ tục Hải quan điện tử và đã triển khai tại tất cả các Chi cục trong năm 2010. Trải qua các phiên bản 2, 3, đến năm 2013, Cục Hải quan Đồng Nai đã triển thủ tục hải quan điện tử theo Phiên bản 4 cho 100% các Chi cục Hải quan và 95% các doanh nghiệp trên địa bàn quản lý.

16/ Năm 2013:
Tiếp tục triển khai thực hiện Dự án hiện đại hoá thu nộp ngân sách giữa các đơn vị ngành tài chính và ngân hàng, đến nay, Cục Hải Quan Đồng Nai đã ký thoả thuận hợp tác phối hợp thu thuế với 12 ngân hàng, gồm: BIDV, Vietinbank, Mbbank, Vietcombank, Agribank, VIB, Techcombank, Eximbank, Maritimebank, VPBank, HD Bank và MHB.
Ra mắt và sử dụng máy soi container hiện đại tại ICD Tân Cảng-Long Bình.
Ra mắt Đội Nghiệp vụ số 3 tại địa bàn KCN Long Đức, huyện Long Thành nhằm luôn sẵn sàng đáp ứng yêu cầu về thủ tục hải quan, rút ngắn thời gian làm thủ tục hải quan cho doanh nghiệp, góp phần hỗ trợ thu hút các dự án đầu tư.
Ra mắt Đội thủ tục phương tiện vận tải xuất nhập cảnh tại cảng Đồng Nai.

Phát huy những kết quả đạt được trong thời kỳ đổi mới, Cục Hải quan Đồng Nai quyết tâm tiếp tục phấn đấu hơn nữa để đưa phương châm “Thuận lợi, tận tụy, chính xác” của ngành trở thành hiện thực, giữ vững vai trò tiên phong trong cải cách, hiện đại hóa để nhằm xứng đáng với danh hiệu cao quý “Anh hùng lao động thời kỳ đổi mới”.