Hoạt động xuất, nhập khẩu trên địa bàn tỉnh Thanh Hóa tương đối ổn định. Tuyến biên giới đường bộ (cửa khẩu Quốc tế Na Mèo và cửa khẩu Tén Tằn) hàng hóa xuất khẩu chủ yếu là vật liệu xây dựng (xi măng, thép xây dựng,...), hàng tiêu dùng; Hàng nhập khẩu chủ yếu là gỗ đã chế biến, nan, nứa thanh… Tuyến cảng biển, cảng sông (cảng Lễ Môn, Nghi Sơn) hàng hóa xuất khẩu chủ yếu là đá trắng, gỗ dăm, xi măng; Hàng hóa nhập khẩu chủ yếu là than cám; Các mặt hàng tạm nhập - tái xuất chủ yếu là thiết bị máy móc phục vụ cho dự án khu công nghiệp trên địa bàn.

Tình hình buôn lậu, gian lận thương mại và hàng giả trên địa bàn tỉnh tuy không nổi cộm nhưng vẫn còn tiềm ẩn những yếu tố phức tạp, khó lường; tình trạng vận chuyển, tàng trữ, buôn bán trái phép hàng cấm, hàng lậu, hàng không đảm bảo vệ sinh an toàn thực phẩm vẫn còn diễn ra. Trước tình hình đó, Ban Chỉ đạo 389 tỉnh đã triển khai nhiều biện pháp quyết liệt nhằm phát hiện, ngăn chặn, xử lý kịp thời vi phạm.

Vụ việc điển hình có thể kể đến là: Ngày 28/02/2018, Chi cục Quản lý thị trường tỉnh Thanh Hóa trình Chủ tịch UBND tỉnh ban hành Quyết định xử phạt vi phạm hành chính đối với ông Lê Văn Hòa, có địa chỉ tại thị xã Hương Thủy, tỉnh Thừa Thiên Huế về hành vi vận chuyển thuốc lá điếu nhập lậu. Phạt tiền 85 triệu đồng; Tịch thu 3.000 bao thuốc lá nhãn hiệu HERO; 440 bao thuốc lá điếu nhãn hiệu ESSE GOLDEN LEAF; 80 bao thuốc lá điếu nhãn hiệu ESSE Ligts; 120 bao thuốc lá điếu nhãn hiệu ESSE Classic do nước ngoài sản xuất.