Về vấn đề này, Tổng cục Hải quan đã có văn bản số 4566/TCHQ-GSQL ngày 08/08/2013 để giải đáp thắc măc. Theo đó, văn bản của Tổng cục Hải quan cho biết:

Phế liệu, phế phẩm nằm trong định mức sử dụng, định mức tiêu hao và tỉ lệ hao hụt thuộc trường hợp miễn thuế quy định tại điểm d, khoản 4, Điều 101 Thông tư số 194/2010/TT-BTC ngày 06/12/2010 của Bộ Tài chính.

Trường hợp phế liệu, phế phẩm còn giá trị thương mại nằm trong định mức sử dụng Công ty bán tiêu thụ nội địa thì thực hiện theo quy định tại điểm d3, khoản 5, Điều 113 Thông tư số 194/2010/TT-BTC dẫn trên. Theo đó, Công ty không phải mở tờ khai xuất nhập khẩu tại chỗ, không phải nộp  thuế nhập khẩu nhưng phải kê khai, nộp các loại thuế khác như thuế giá trị gia tăng, thuế thu nhập doanh nghiệp theo đúng quy định.

Quy định tại điểm a, khoản 2, Điều 23 Thông tư số 117/2011/TT-BTC ngày 15/08/2011 của Bộ Tài chính áp dụng đối với trường hợp phế liệu, phế phẩm nằm ngoài định mức sử dụng.