Theo đó, công văn đã hướng dẫn cụ thể như sau, hàng hóa nhập khẩu (NK) thuộc trường hợp quy định tại điểm a khoản 3 Điều 5 Luật  Thuế xuất, nhập khẩu (Thuế suất ưu đãi đặc biệt áp dụng đối với hàng hóa NK có xuất xứ từ nước, nhóm nước hoặc vùng lãnh thổ có thỏa thuận ưu đãi đặc biệt về thuế NK trong quan hệ thương mại với Việt Nam; hàng hóa từ khu phi thuế quan nhập khẩu vào thị trường trong nước đáp ứng điều kiện xuất xứ từ nước, nhóm nước hoặc vùng lãnh thổ có thỏa thuận ưu đãi đặc biệt về thuế NK trong quan hệ thương mại với Việt Nam) thì áp dụng mức thuế suất ưu đãi quy định cho từng mặt hàng tại Mục I, Mục II, Mục III Phụ lục II Nghị định số 122/2016/NĐ-CP của Chính phủ. 

Còn đối với những hàng hóa trên cũng được áp dụng mức thuế suất ưu đãi đặc biệt quy định cho từng mặt hàng tại các nghị định ban hành Biểu thuế nhập khẩu ưu đãi đặc biệt của Việt Nam để thực hiện các hiệp định thương mại tự do bao gồm Hiệp định Việt Nam- Hàn Quốc (VKFTA), ASEAN- Hàn Quốc (AKFTA), Việt Nam- Nhật Bản (VJFTA), ASEAN- Nhật Bản (AJFTA), ASEAN- Trung Quốc (ACFTA), ASEAN- Úc- Niu-di-lân (AANZFTA), ASEAN- Ấn Độ (AIFTA), ATIGA và Việt Nam- Chilê (VCFTA), Hiệp định song phương Việt Nam- Lào.

Riêng hàng hóa nhập khẩu thuộc trường hợp quy định tại điểm c khoản 3 Điều 5 Luật Thuế xuất, nhập khẩu (không thuộc trường hợp áp dụng thuế suất ưu đãi hoặc thuế suất ưu đãi đặc biệt quy định 2 điểm trên) thì áp dụng thuế suất thông thường như sau: