Năm 2016, tập thể Cục Hải quan Hà Nội đã nỗ lực hoàn thành thắng lợi nhiệm vụ được giao, các chỉ tiêu cơ bản, quan trọng đều đạt và vượt, đáng chú ý, đơn vị đã thu nộp ngân sách 20.002 tỷ đồng đạt 110% chỉ tiêu pháp lệnh được giao (18.200 tỷ đồng) và đạt 102% chỉ tiêu phấn đấu (19.600 tỷ đồng). 

Bước sang năm 2017, để thực hiện chỉ tiêu thu NSNN 20.650 tỷ đồng, Cục Hải quan Hà Nội đã sớm giao chỉ tiêu cho từng đơn vị thuộc và trực thuộc Cục. Trong đó, các đơn vị trong địa bàn Hà Nội (gồm các chi cục: cửa khẩu sân bay quốc tế Nội Bài, Bắc Hà Nội, Chuyển phát nhanh, Gia Thụy, Ga đường sắt quốc tế Yên Viên, Đầu tư-gia công, Bắc Thăng Long, Hà Tây, Phòng Thuế XNK, Chi cục Kiểm tra sau thông quan) tổng số thu được giao là 17.200 tỷ đồng. Đối với các đơn vị ngoài địa bàn Hà Nội (Vĩnh Phúc, Phú Thọ, Yên Bái, Hòa Bình) tổng số thu được giao là 3.450 tỷ đồng.

Một số đơn vị được giao chỉ tiêu cao gồm: Chi cục Hải quan Bắc Hà Nội 4.160 tỷ đồng; tiếp đến là Chi cục Hải quan quản lý hàng đầu tư-gia công: 3.668 tỷ đồng; Chi cục Hải quan cửa khẩu sân bay quốc tế Nội Bài: 3.150 tỷ đồng, Chi cục Hải quan Vĩnh Phúc là 3.000 tỷ đồng.

Để thực hiện chỉ tiêu thu NSNN, năm 2017 Cục Hải quan đã Nội tiếp tục thực hiên đồng bộ các nhóm giải pháp tạo thuận lợi đối đa cho hoạt động xuất nhập khẩu để thu hút doanh nghiệp trên địa bàn Thủ đô làm thủ tục tại đơn vị; tăng cường công tác quản lý thuế, thu hồi nợ thuế; chống thất thu qua trị giá tính thuế, qua áp mã số hàng hóa.

Song song, đơn vị chú trọng theo dõi diễn biến tình hình các yếu tố tác động đến thu NSNN; xác định các chi cục, địa bàn có nguồn thu lớn, mặt hàng nhập khẩu trọng điểm, dự báo nguồn thu có khả năng tăng thu cho NSNN; thường xuyên rà soát các mặt hàng có thuế suất cao, khả năng gian lận về giá cao để báo cáo Tổng cục Hải quan đề xuất sửa đổi, bổ sung Danh mục quản lý rủi ro hàng nhập khẩu, xuất khẩu.