Một là: Tiếp nhận, phân loại giải quyết hồ sơ hoàn thuế GTGT.

Cơ quan thuế (CQT) tiếp nhận hồ sơ hoàn thuế, phân loại giải quyết hồ sơ hoàn thuế GTGT theo đúng hướng dẫn tại Thông tư số 156/2013/TT-BTC ngày 06/11/2013 của Bộ Tài chính. Trường hợp, trong quá trình giải quyết hồ sơ hoàn thuế, phát hiện người nộp thuế (NNT) có dấu hiệu vi phạm pháp luật thuế, pháp luật hải quan hoặc trường hợp nếu NNT không giải trình, bổ sung hồ sơ hoàn thuế hoặc có giải trình, bổ sung nhưng không chứng minh được số thuế đã khai là đúng, CQT thay đổi việc áp dụng hình thức phân loại hồ sơ hoàn thuế của NNT đang thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau sang thuộc diện hồ sơ kiểm tra trước hoàn thuế sau; việc phê duyệt thay đổi áp dụng hình thức phân loại phải được cập nhật vào hệ thống thông tin nghiệp vụ và phải được thông báo cho DN theo đúng quy định tại Điểm 2, Khoản 18, Điều 1 Luật 21/2012/QH13 ngày 20/11/2012 sửa đổi bổ sung Điều 60 của Luật Quản lý thuế số 78/2006/QH11 ngày 29/14/2006.

Hai là: Trách nhiệm về Quyết định hoàn thuế và tổ chức thực hiện việc giải quyết hoàn thuế GTGT.

- Cục trưởng Cục Thuế có trách nhiệm về Quyết định hoàn thuế và tổ chức thực hiện việc giải quyết hoàn thuế GTGT; rà soát các trường hợp thường xuyên phát sinh hoàn thuế và phân cấp Cục Thuế trực tiếp quản lý thuế theo hướng dẫn tại Thông tư 127/2015/TT-BTC ngày 21/8/2015 của Bộ Tài chính hướng dẫn cấp mã số DN thành lập mới và phân công CQT quản lý đối với DN; về quản lý rủi ro trong hoàn thuế GTGT theo quy định tại Khoản 3, Điều 23, Thông tư số 204/2015/TT-BTC ngày 21/12/2015:

- Cục Thuế phải thực hiện cập nhật đầy đủ tờ khai thuế, hồ sơ đề nghị hoàn thuế và các thông tin liên quan đến quá trình giải quyết hoàn thuế cho NNT (Phiếu đề xuất hoàn thuế, biên bản kiểm tra), dự thảo quyết định hoàn thuế vào Hệ thống quản lý thuế của ngành thuế (TMS, TTR), đồng thời, gửi danh sách đề nghị phê duyệt Quyết định hoàn thuế GTGT về Tổng cục Thuế qua hệ thống thư điện tử (HoanthueTCT@gdt.gov.vn).

- Tổng cục Thuế có trách nhiệm giám sát, kiểm tra hồ sơ giải quyết hoàn thuế trên Hệ thống TMS, TTR. Trường hợp Cục Thuế đã thực hiện đầy đủ, đúng quy định, trong thời gian không quá 6 giờ làm việc, Tổng cục Thuế Thông báo kết quả giám sát hoàn thuế GTGT (hồ sơ đủ điều kiện ban hành Quyết định hoàn thuế hoặc hồ sơ không đủ điều kiện ban hành Quyết định hoàn thuế) gửi Cục Thuế qua hệ thống thư điện tử. Căn cứ kết quả Thông báo của Tổng cục Thuế, Cục Thuế ban hành quyết định hoàn thuế và tự động cập nhật hệ thống cơ sở dữ liệu về NNT.

- Tổng cục Thuế kiểm tra, xác định xác định hồ sơ đủ điều kiện ban hành Quyết định hoàn thuế nếu: Hồ sơ khai thuế GTGT, Văn bản đề nghị hoàn thuế GTGT của NNT được thực hiện đúng quy định, đồng thời, được cập nhật đầy đủ vào Hệ thống TMS; Phiếu đề xuất hoàn thuế, biên bản kiểm tra (đối với trường hợp kiểm tra trước hoàn thuế, văn bản thẩm định hồ sơ đề nghị hoàn thuế), dự thảo quyết định hoàn thuế được thực hiện đảm bảo đúng trình tự và đúng thẩm quyền.

- Thời gian giám sát, kiểm tra hồ sơ hoàn thuế của Tổng cục Thuế không tính trong thời gian giải quyết hồ sơ hoàn thuế của Cục Thuế.

Ba là: Thực hiện kiểm tra, thanh tra sau hoàn thuế đối với hồ sơ thuộc diện hoàn thuế trước kiểm tra sau.

Tổng cục Thuế có trách nhiệm giao cụ thể chỉ tiêu kế hoạch thanh tra, kiểm tra sau hoàn thuế đối với hồ sơ thuộc diện hoàn thuế trước kiểm tra sau và đảm bảo theo đúng quy định tại Điều 23, Thông tư 204/2015/TT-BTC và theo đúng quy định của pháp luật.

Bốn là: Tiếp tục thực hiện nghiêm các quy định về công tác quản lý hoàn thuế GTGT.

Việc hoàn thuế GTGT tiếp tục được thực hiện theo quy định của pháp luật về quản lý thuế và theo hướng dẫn tại các công văn: số 10492/BTC-TCT ngày 30/7/2015; số 11797/BTC-TCT ngày 22/8/2014; số 12485/BTC-TCT ngày 18/9/2013; số 10024/BTC-TCT ngày 22/7/2014; số 1752/BTC-TCT ngày 10/2/2014; Công văn số 875/BTC-TCT ngày 17/01/2014 của Bộ Tài chính.

Bãi bỏ quy định tại các Điểm 1, 2, 4 và 5 của công văn số 18832/BTC-TCT ngày 17/12/2015 và các Điểm 3 (khổ thứ hai), 4, 5, 6 của công văn số 13822/BTC-TCT ngày 02/10/2015 của Bộ Tài chính.

Việc quản lý chi và thủ tục hoàn thuế GTGT trên đây được thực hiện ngay từ ngày 14/3/2016 sẽ góp phần thuận lợi hơn cho CQT địa phương và NNT./.