Dự thảo Thông tư quy định cụ thể các quy trình xử lý của việc nộp thuế của người khai hải quan bằng chuyển khoản và bằng tiền mặt; đối chiếu dữ liệu và xử lý sai sót trong đối chiếu giữa cơ quan Hải quan với tổ chức tín dụng; đối chiếu dữ liệu và xử lý sai sót trong đối chiếu giữa cơ quan Hải quan với Kho bạc Nhà nước tương ứng; Xử lý sai sót về dữ liệu nộp tiền; mô hình trao đổi thông tin nộp thuế giữa Tổng cục Hải quan- Kho bạc Nhà nước- Tổ chức tín dụng…

Cụ thể, dự thảo Thông tư quy định, người nộp thuế xác định số tiền thuế phải nộp cho từng loại thuế gửi tổ chức tín dụng, Tổ chức tín dụng sử dụng thông tin trên Cổng thông tin điện tử hải quan để kiểm tra, đối chiếu với thông tin người nộp thuế kê khai.

Nếu thông tin phù hợp, chuyển tiền từ tài khoản người nộp thuế vào tài khoản của Kho bạc Nhà nước, đồng thời truyền đầy đủ dữ liệu thông tin thanh toán theo đúng định dạng thống nhất đến Kho bạc Nhà nước và truyền thông tin thu đến cơ quan Hải quan.

Nếu thông tin chưa phù hợp về mã số thuế hoặc tên người nộp thuế, hoặc số tiền thuế, số tờ khai, người nộp thuế phải làm rõ thông tin trước khi chuyển tiền. Nếu các thông tin khác chưa phù hợp, tổ chức tín dụng phối hợp với cơ quan Hải quan kiểm tra và bổ sung các thông tin trong cơ sở dữ liệu.

Sau khi nhận được thông tin do tổ chức tín dụng chuyển, Kho bạc Nhà nước thực hiện hạch toán kế toán số tiền phát sinh vào khoản thu ngân sách nhà nước hoặc tài khoản tiền gửi của cơ quan Hải quan, 15 phút/lần truyền đầy đủ dữ liệu theo đúng định dạng thống nhất cho cơ quan Hải quan.

Cơ quan Hải quan nhận được thông tin của tổ chức tín dụng, Kho bạc Nhà nước gửi đến sẽ cập nhật thông tin nộp tiền và hạch toán thanh toán cho người nộp thuế…

Theo đại diện của Cục Thuế XNK (Tổng cục Hải quan), dự thảo Thông tư được xây dựng nhằm gỡ vướng và giảm bớt thời gian nộp thuế của doanh nghiệp. Bởi thời gian qua, nhiều doanh nghiệp bức xúc vì đã trích tiền từ tài khoản ngân hàng nộp thuế cho hàng hóa XNK nhưng phải mất khoảng từ 2 đến 3 ngày, doanh nghiệp mới được cơ quan Hải quan xác nhận hoàn thành nghĩa vụ nộp ngân sách Nhà nước do chậm trễ trong kết nối thông tin giữa Kho bạc và cơ quan hải quan.

Hiện dự thảo Thông tư đang được Tổng cục Hải quan lấy ý kiến góp ý của các ngân hàng.