Quy trình kiểm soát, thanh toán dự án sử dụng vốn đầu tư công qua hệ thống KBNN được ban hành kèm theo Quyết định số 890/QĐ-KBNN ngày 2/3/2022 của KBNN. Quy trình được áp dụng cho KBNN các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương; Sở Giao dịch KBNN, KBNN quận, huyện, thị xã, thành phố và công chức được phân công nhiệm vụ liên quan đến quy trình kiểm soát, thanh toán dự án sử dụng vốn đầu tư công qua hệ thống KBNN.

Theo đó, KBNN sẽ áp dụng phương thức “thanh toán trước, kiểm soát sau” đối với khoản chi có hợp đồng và thực hiện thanh toán nhiều lần cho đến khi giá trị giải ngân đạt 80% giá trị hợp đồng.

Trường hợp số vốn đã giải ngân chưa đạt 80% giá trị hợp đồng nhưng chủ đầu tư đề nghị thanh toán lần cuối thì KBNN nơi giao dịch phải thực hiện hình thức “kiểm soát trước, thanh toán sau”.

Thời gian kiểm soát, thanh toán vốn là tối đa 3 ngày làm việc kể từ ngày nhận đủ hồ sơ thanh toán của chủ đầu tư theo quy định tại Nghị định 99/2021/NĐ-CP ngày 11/11/2021 của Chính phủ, KBNN nơi giao dịch phải hoàn thành việc kiểm soát, thanh toán cho dự án.